智慧醫療
- 生醫資訊-國網生科雲
- 生醫影像-iSlide虛擬數位病理切片影像檢視與註解系統
- Flycircuit:三維腦神經網路圖譜資料庫
- 個人化的醫療影像處理與虛擬實境
- XBrain影像資料庫管理系統與大尺度視覺化系統
以叢集式高效能或雲端計算主機為基礎,提供生命科學、醫學與農業領域分析計算時所需之函式庫、分析軟體、套裝程式等,並根據生物計算類之特性,將計算平台效能調教至最佳化,提供計算服務。
在應用上可提供大尺度之基因體分析計算,全基因體之間比對、關聯性分析,找尋生物標記、特定影像樣式,提供遺傳背景,以找尋疾病成因,解碼生命藍圖,以探究生命科學之奧秘。另可建立與疾病相關之生物標記與人工智慧辨識模型,提供農業、精準醫療檢測產品應用,讓自動化農業、醫學臨床分析流程等大規模資料,透過雲端分析平台服務,紓解大量常規性檢測分析需求。國網中心亦可提供客製化研發分析平台,建置生物資訊系統與資料庫。
生醫資訊-國網生科雲
服務網址:http://lions.nchc.org.tw/
聯絡窗口:王先生
1303001@narlabs.org.tw
iSlide虛擬數位病理切片影像檢視與註解系統,可檢視數位病理切片影像,並能在極短暫的時間內預覽全像圖乃至細胞層次。一般將數位病理切片影像放大至細胞層次需要耗費大量資源運算,但iSlide支持各大廠牌數位病理切片影像格式和設備,且平台建置於可擴展的雲存儲與高性能和高安全性的伺服器,利用細緻化貝茲曲線區塊儲存診斷註釋,並以標準化XML和JSON格式呈現,可讓研究人員輕鬆進行協作和共享診斷註釋。iSlide預留標準化輸入/輸出接口,可用於病理診斷深度學習分析開發應用。
例如,應用於醫學病理影像檢測相關產品,可輕易的與現有病理學檢測標準步驟結合,提升臨床資訊與AI技術與資料結合的機會。
生醫影像-iSlide
服務網址:http://islide.nchc.org.tw/slide/
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0203126@narlabs.org.tw
神經的網路結構一直是生物學家感興趣的研究課題。研究者相信神經間的拓樸結構和神經傳導訊息的傳遞路徑息息相關,並可從中了解神經所被賦予扮演的功能角色。因此國網中心利用自身的高速計算能力與收集分析BIG DATA能量,協助國內研究學界從事腦神經網路研究,進而建置全腦網路資訊傳輸圖譜,完成建置一典藏約30,000條腦神經三維影像之資料庫。此資料庫為目前為世界上最大單一物種之三維神經影像資料庫,也是唯一提供研究學者目前最迫切了解的神經訊息傳遞路徑預測工具。因此研究人員能利用這一完整的腦神經網路資訊傳輸圖譜,將有助益於研究退化性神經疾病的致病機轉及治療方式。
Flycircuit : 三維腦神經網路圖譜資料庫
服務網址:http://www.flycircuit.tw/
聯絡窗口:莊先生
0203126@narlabs.org.tw
● 技術簡介
針對醫療影像處理與VR互動提供完整方案,首先經由使用Miil (Medical image illustrator) 醫療影像處理與標記工具針對影像去處理找出所需觀察的組織或器官,再經由VVViewer(Visualization interactive media lab's VR Viewer) VR瀏覽互動工具程式進行互動與3D環境下的觀察。
● 科學突破
- VVViewer可將原本的三維醫療影像資料,透過VR的方式呈現與互動,在虛擬的三維空間內直接操作並觀察人體內部,避免透過一般螢幕去想像,並由平面的鍵盤滑鼠去操作三維空間內容的困擾。
- 結合三維醫療影像標記處理軟體MiiL,即時透過半自動的方式處理三維醫療影像,交給VVViewer觀察。
● 產業應用
可應用在生醫影像標記 (labeling, segmentation)、製作 AI training data、虛擬實境應用、教學訓練、術前規劃、醫病關係等服務。
3D Seed growing與3D Lazy snapping
三維醫療影像標記處理軟體MiiL
VIML VR Viewer
網址:http://viml.nchc.org.tw/home/
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0103115@narlabs.org.tw
● 技術簡介
提供大尺度醫學影像資料(如腦神經影像、血管影像、器官影像等)之資料庫管理系統與視覺化系統。
● 科學突破
從果蠅腦神經資料庫推進到小鼠腦神經資料庫。
● 產業應用
- 大尺度影像資料管理系統:使用者間資料共享、資料共享權限控管。
- 大尺度影像視覺化系統:大尺度影像呈現、分散式影像視覺化技術、遠端程式虛擬化技術
XBrain data management system
大尺度影像視覺化系統
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1003129@narlabs.org.tw