106年9月24日星期日

| IBM Cluster 1350/ 1350A

本中心歷年來TOP500排名最高主機,2007年6月排名35。目前是本中心第二大之高速計算主機

Iris採用IBM Cluster 1350系統,是x86-based的平行計算叢集主機以Infiniband DDR串聯512個計算節點,共2048核心,適用於除GPU加速外之各式領域高速計算。2009年再擴充128個8核心ethernet計算節點,使全機達640個計算節點、3072個計算核心,為目前本中心計算節點數量最多之主機系統。

規格概要(technical summary):

Iris全機總共有512個infiniband 計算節點(簡稱1350)以及128個ethernet計算節點(簡稱1350A)。所有的計算節點都是雙CPU,每個CPU有2核(1350)或4核(1350A);每個節點至少配置16GB RECC DDR2記憶體;內部網路採Fat Tree拓樸。

IBM Cluster 1350/ 1350A
IBM Cluster 1350 1350A
CPU
Intel Xeon 5160
Intel Xeon 5450
CPU頻率(GHz) 3.00
3.00
總核心數 2,048 1,024
單節點核心數
4 8
單節點記憶體(GB) 16 16
總節點數 512 128
內部網路介面
InfiniBand DDR
Ethernet GbE
內部網路拓墣 Fat Tree
計算節點機種 IBM System x3550
平行檔案系統 IBM GPFS
儲存節點數 8
儲存總空間 70TB
計價費率(每核心小時) 1 SU
計算性能Rmax (TFLOPS) 19.90 7.00
計算性能Rpeak (TFLOPS) 24.86 12.29


系統軟體環境(system software environment)

Iris
IBM Cluster 1350 1350A
作業系統
Suse Linux Enterprise Server
叢集管理軟體 IBM Cluster System Management(CSM)
平行檔案系統 IBM GPFS
排程管理系統
IBM LoadLeveler
編譯器 GCC、Intel、PGI C/C ,Fortran
MPI VoltaireMPI、MPICH、MVAPICH、OpenMPI


登入主機(Access):

Iris提供兩座登入節點,請以下列主機名稱或對應IP登入:

irish2.sro.nchc.org.tw (140.110.122.62)

irish3.sro.nchc.org.tw (140.110.122.63)

請以ssh軟體,如putty,MobaXterm或Linux/UNIX系統內建ssh指令登入:

ssh <您的帳號>@irish2.sro.nchc.org.tw

ssh <您的帳號>@irish3.sro.nchc.org.tw

編譯器路徑:

編譯器 版本 路徑 命令
C/C GNU 3.3.3 X86_64 /usr/bin gcc,g
GNU 4.2.0 X86_64 /opt/gcc42/bin
gcc,g
C/C Intel C/C 9.1 /opt/intel/cce/9.1.049/bin icc
PGI C/C 6.2 X86_64 /opt/pgi/linux86-64/6.2/bin pgcc,pgCC
Fortran GNU 3.3.3 X86_64 /usr/bin f77,g77
GNU 4.2.0 X86_64 /opt/gcc42/bin f77,g77,gfortran
Fortran Intel Fortran 9.1 /opt/intel/fce/9.1.045/bin ifort

PGI Fortran 6.2 X86_64

/opt/pgi/linux86-64/6.2/bin pgf77,pgf90



磁碟空間:

磁碟路徑 磁碟空間大小 使用限制 定期刪除檔案
/家目錄 545 GB 50MB
/work1 2.13 TB 150GB 超過二星期以上沒有access
/work2 2.13 TB 150GB 超過二星期以上沒有access
/work3 4.36 TB 300GB 超過二星期以上沒有access
/work4 4.36 TB 150GB 超過二星期以上沒有access

編譯MPI程式

請見: https://service.nchc.org.tw/faq/faq_answer.php?faqidnum=246

遞交計算工作

Iris系統採用IBM LoadLeveler排程管理系統,計算工作必須透過排程系統遞交後,依不同隊列計算優先權,再派送計算工作至計算節點。

遞交方式請見: https://service.nchc.org.tw/faq/faq_answer.php?faqidnum=176

排程系統相關指令:

1.查看所有的計算工作,使用”llq”指令

2.查看自己帳號的計算工作,使用”llq -u $USER”指令

3.觀看節點狀態,使用”llstatus”指令

4.查看各種隊列(queue)之總可用核心與空閒核心,使用”llclass”指令

5.刪除自己的計算工作,使用”llcancel <計算工作>” 指令

使用上若有任何問題或有其他特殊申請需求與合作,請直接聯絡HPC客戶諮詢櫃台或管理者:
呂小姐 (03)5776085 #442 account@nchc.narl.org.tw

回首頁 | 到頂端 | 上一頁
  設施與服務 研發與合作 使用者專區 科研成果
媒體中心
有關國網 相關連結
© All Rights Reserved 2005-2014 國家高速網路與計算中心|網站管理員信箱 webmaster@narlabs.org.tw 瀏覽人次 : 885,777