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臺灣AI雲集結跨國資源 共助新冠病毒醫療研發

2020.05.13

國研院國網中心於2020/4/2啟動「御守臺灣・科技抗疫」專案 ,釋出國際級超級電腦「臺灣AI雲」 之計算力、儲存及大數據資料集等資源,免費開放各界提案申請運用抗擊疫情。美國IC設計大廠NVIDIA、全球科技龍頭IBM、全球最大生物資訊解決方案暨診斷檢測方案商QIAGEN,生物模擬計算大廠Schrödinger,亦響應國網中心的御守台灣科技抗疫專案, 支援專業的資料庫與分析開發工具,結合臺灣AI雲的高速運算能力,為進行COVID-19相關藥物研發的學研單位科學家提供更充沛的資源,加速抗疫進程。

NVIDIA 


NVIDIA Parabricks 基因序列分析軟體針對醫療的研究提供助益,讓用於執行次世代基因定序(NGS)DNA數據的二次分析的軟體,以超快速度和低成本方式,從原本的數日減少至不到一小時,便可產出分析結果。這項功能可以加速探索病毒跟人類基因體之間是否存在著可能的交互作用或相互的演化關係,有助於了解類似疾病發生時,提供評估疫情所需的科學證據。以臺灣AI雲搭配Parabricks中的分析工具,將加快醫療研發分析基因組定序資料的速度達50 倍,強化臺灣以科技抵禦新冠病毒(COVID-19)的能量。



IBM 


IBM Functional Genomics Platform包含超過3億條來自千種微生物的分子序列(DNA、RNA和蛋白質序列),並提供出其中許多基因、蛋白質功能區域和代謝路徑,這些都是開發病原體診斷和治療所必需的標的, 以探索病毒和細菌基因組中的分子特徵,讓進行藥物相關研究的科學家與研究員們,加速尋找新冠病毒COVID-19用藥標的。



QIAGEN


QIAGEN將提供旗下兩大生物資訊分析軟體,分別為基因定序軟體(CLCBio Genomic Workbench)以及路徑分析軟體(Ingenuity Pathway Analysis, IPA)。

在臺灣AI 雲強力運算能力下搭配QIAGEN基因定序軟體,可將大量的基因體定序資料以多節點、多工以、客製化分析流程的運算方式大幅提升運算效率。分析完的序列資訊可直接傳輸到路徑分析軟體,進一步研究生物體受到COVID-19感染後的傷害。



Schrödinger


Schrödinger Full Suite為生物醫藥模擬設計軟體,搭配臺灣 AI 雲,讓高效虛擬藥物篩選應用於藥物合成設計、老藥新用、毒性毒理分析等議題,計算效率將提升50倍以上,縮短開發治療藥物所需的時間。


  • 授權免費使用1個月
  • Schrödinger服務介紹:  https://www.schrodinger.com/
  • 申請聯繫 : 創源生技 蔡主任 (clairtsai@gga.asia) 


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